Jordi Vizcaíno arriba a la banqueta del primer equip femení de la Penya en el mes de gener de 2022, reemplaçant Guillem Abelló, per salvar l'equip de la pèrdua de categoria, objectiu assolit amb escreix. La temporada següent classifica l'equip pel playoff d'ascens a Lliga Femenina, i la 2023-24 guanya el playoff d'ascens i s'aconsegueix pujar a la Lliga Femenina. Aquest ascens li va valdre la renovació, el que significarà el seu debut com a entrenador a la màxima categoria.

En el mes de gener de 2026, després d'una temporada i mitja a Lliga Femenina, el club decideix no seguir comptant amb ell. L'equip es trobava a la desena posició i sense opcions de jugar la Copa.

Va ser entrenador ajudant de la selecció espanyola sub18 l'any 2013. Aquest mateix any la Federació Catalana el va reconèixer com el millor entrenador d'equips femenins en l'àmbit català.